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SDS-PAGE電泳可用于分離蛋白質(zhì)和核苷酸 ,這里綜述了SDS-PAGE實(shí)驗(yàn)原理、試劑和器材、以及實(shí)驗(yàn)操作步驟。
一. 實(shí)驗(yàn)原理:
SDS-PAGE是對蛋白質(zhì)進(jìn)行量化,比較及特性鑒定的一種經(jīng)濟(jì)、快速、而且可重復(fù)的方法。該法是依據(jù)混合蛋白的分子 量不同來進(jìn)行分離的。
SDS是一種去垢劑,可與蛋白質(zhì)的疏水部分相結(jié)合,破壞其折疊結(jié)構(gòu),并使其廣泛存在于一個(gè)廣泛均一的溶液中。SDS蛋白質(zhì)復(fù)合物的長度與其分子量成正比。在樣品介質(zhì)和凝膠中加入強(qiáng)還原劑和去污劑后,電荷因素可被忽略。蛋白亞基的遷移率取決于亞基分子量。
二. 試劑和器材:
試劑:1. 5x樣品緩沖液(10ml):0.6ml 1mol/L的Tris-HCl(pH6.8),5ml 50%甘油,2ml 10%的SDS,0.5ml巰基乙醇,1ml 1%溴酚藍(lán),0.9ml蒸餾水。可在4℃保存數(shù)周,或在-20℃保存數(shù)月。
2. 凝膠貯液:在通風(fēng)櫥中,稱取丙烯酰胺30g,甲叉雙丙烯酰胺0.8g,加重蒸水溶解后,定容到100ml。過濾后置棕色瓶中,4℃保存,一般可放置1個(gè)月。
3. pH8.9分離膠緩沖液: Tris 36.3g ,加1mol/L HCl 48ml,加重蒸水80ml使其溶解,調(diào)pH8.9,定容至100ml, 4℃保存。
4. pH6.7濃縮膠緩沖液: Tris 5.98g ,加1mol/L HCl 48ml,加重蒸水80ml使其溶解,調(diào)pH6.7,定容至100ml, 4℃保存。
5. TEMED(四乙基乙二胺)原液
6.10%過硫酸銨(用重蒸水新鮮配制)
7. pH8.3 Tris-甘氨酸電極緩沖液:稱取Tris 6.0g,甘氨酸28.8g,加蒸餾水約900ml,調(diào)pH8.3后,用蒸餾水定容至1000ml。置4℃保存,臨用前稀釋10倍。
8. 考馬斯亮藍(lán)G250染色液:稱100mg考馬斯亮藍(lán)G250,溶于200ml蒸餾水中,慢慢加入7.5ml 70%的過氯酸,zui后補(bǔ)足水到250ml,攪拌1小時(shí),小孔濾紙過濾。
器材:電泳儀 ,電泳槽,水浴鍋,搖床。
三. 實(shí)驗(yàn)操作;
1. 樣品制備
將蛋白質(zhì)樣品與5X樣品緩沖液(20ul+5ul)在一個(gè)Eppendorf管中混合。放入100℃加熱5-10min,取上清點(diǎn)樣。
2. 分離膠及濃縮膠的制備
① 將玻璃板、樣品梳、Spacer用洗滌劑洗凈,用ddH2O沖洗數(shù)次,再用乙醇擦拭,晾干;
② 將兩塊洗凈的玻璃板之間加入Spacer,按照Bio-Rad Mini Ⅱ/Ⅲ說明書提示裝好玻璃板;
③ 按如下體積配制10%分離膠8.0 ml,混勻:ddH2O 3.0 ml;1.0 mol/LTris-HCl pH=8.8 2.1 ml;30% Acr-Bis 2.8 ml;10% SDS 80 ul;10%AP 56 ul;TEMED 6 ul。
④ 向玻璃板間灌制分離膠,立即覆一層重蒸水,大約20 min后膠即可聚合;
⑤ 按如下體積配制6%濃縮膠3.0 ml,混勻:ddH2O 1.0 mol/LTris-HClpH=6.8 30% Acr-Bis;2.0 ml 400 ul 600 ul;10% SDS 10% AP TEMED;36ul 24ul 4ul。
⑥ 將上層重蒸水傾去,濾紙吸干,灌制濃縮膠,插入樣品梳;
⑦ 裝好電泳系統(tǒng),加入電極緩沖液,上樣20 μl;
⑧ 穩(wěn)壓200V,溴酚藍(lán)剛跑出分離膠時(shí),停止電泳,約需45 min~1hr.
⑨ 卸下膠板,剝離膠放入染色液中,室溫染色1~2 hr;加入脫色液,置于80 rpm脫色搖床上,每20 min更換一次脫色液(10 ml 冰乙酸;45 ml乙醇;45 ml蒸餾水)至*脫凈。
聚丙烯酰胺凝膠具有分子篩效應(yīng),可根據(jù)蛋白亞基分子量不同將分離蛋白,SDS-PAGE電泳凝膠好壞直接關(guān)系到電泳能否成成,一般濃縮膠和分離膠的pH分別是6.7和8.9.
編輯: 嗚咽
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